データフレーム#
データフレーム(DataFrame)は Polars の中心的なデータ構造で、行と列からなる2次元の表を表します。各列はひとつのデータ型を持ち、列ごとに型が異なっていてもかまいません。
「列単位で保持し、列単位で型を管理する」という設計が Polars の速さの源であり、使い方の作法もそこから決まります。列に対する操作を中心に書き、行単位で値を取り出すのは避けるのが基本です。この章では、まずデータフレームの作り方、続いて列・行・単一値の取り出し方を説明します。
import polars as pl
from helper.jupyter import row
データフレームの作成#
ここでは、Python の他のオブジェクトからデータフレームを作る方法を説明します。データを手で書くことはほとんどありませんが、テスト用の小さな例は必ず作ることになります。作り方では、列名をどこから取るかと、型をどう推論するかの2つを決めます。dict[list] なら列名は辞書のキーになります。list[list] では列名が既定で column_0、column_1 といった仮の名前になるので、変えたいときは schema を渡します。型は Polars が値から推論します。整数と None だけの列は Int64 のままですが、整数と文字列が同じ列に混じるとエラーになります。strict=False を渡せば通りますが、そのとき列全体が String になります。
リストと辞書の組み合わせ#
次のプログラムは、Python の異なるデータ構造(辞書のリスト、リストの辞書、リストのリスト)から DataFrame を作ります。
辞書のリスト(
list[dict])— 辞書のキーが列名になり、リスト内の各辞書が1行分のデータになります。リストの辞書(
dict[list])— 辞書のキーが列名になり、各リストの要素がその列のデータになります。リストのリスト(
list[list])—schema引数で列名を指定します。orient='row'なら、データの方向が行単位であることを指定します。内側のリスト1つが1行分のデータになります。orient='col'なら、データの方向が列単位であることを指定します。内側のリスト1つが1列分のデータになります。この例では内側のリストのデータ型がそろっていないため、strict=Falseで自動型変換を有効にします。
# list[dict]
dict_in_list = [
{"name": "Alice", "age": 30},
{"name": "Bob", "age": 25},
{"name": "Charlie", "age": 35}
]
df1 = pl.DataFrame(dict_in_list)
# dict[list]
list_in_dict = {
"name": ["Alice", "Bob", "Charlie"],
"age": [30, 25, 35],
}
df2 = pl.DataFrame(list_in_dict)
# list[list]
list_in_list = [
["Alice", 30],
["Bob", 25],
["Charlie", 35]
]
columns = ["name", "age"] # カラム名を指定
df3 = pl.DataFrame(list_in_list, schema=columns, orient='row')
df4 = pl.DataFrame(list_in_list, schema=['p1', 'p2', 'p3'], orient='col', strict=False)
row(df1, df2, df3, df4)
shape: (3, 2)
|
shape: (3, 2)
|
shape: (3, 2)
|
shape: (2, 3)
|
data は辞書で、値は次の2種類です。
"point"キーの値は辞書のリスト(list[dict])で、各辞書にはxとyの2つのキーが含まれています。"weight"キーの値は整数のリスト(list[int])です。
データフレームに変換すると、外側の辞書のキーが列名になり、point 列の要素は Struct 型(構造体)に変換されます。
data = {
"point": [{"x": 1, "y": 2}, {"x": 3, "y": 4}, {"x": 5, "y": 6}],
"weight": [5, 4, 8],
}
pl.DataFrame(data)
| point | weight |
|---|---|
| struct[2] | i64 |
| {1,2} | 5 |
| {3,4} | 4 |
| {5,6} | 8 |
NumPy の配列#
NumPy の配列は、リストと同じように扱えます。
dict[list]とdict[1次元配列]は同じlist[list]と 2次元配列は同じ
import numpy as np
array_in_dict = {
"x": np.array([1, 3, 5]),
"y": np.array([2, 4, 6]),
}
df1 = pl.DataFrame(array_in_dict)
array_2d = np.array([[1, 2], [3, 4], [5, 6]])
df2 = pl.DataFrame(array_2d, schema=['x', 'y'], orient='row')
df3 = pl.DataFrame(array_2d, schema=['p1', 'p2', 'p3'], orient='col')
row(df1, df2, df3)
shape: (3, 2)
|
shape: (3, 2)
|
shape: (2, 3)
|
1次元の構造化配列をデータフレームに変換すると、配列の各フィールドがデータフレームの各列になります。
arr = np.array([
(1, 30),
(2, 25),
(3, 35)], dtype=[('x', 'i2'), ('y', 'i2')])
pl.DataFrame(arr)
| x | y |
|---|---|
| i16 | i16 |
| 1 | 30 |
| 2 | 25 |
| 3 | 35 |
Series を含むデータ#
pl.Series を扱うときは、list[Series] や dict[Series] をデータフレームに変換することがよくあります。どちらの場合も各 Series がデータフレームの列になりますが、列名の扱いが異なります。
list[Series]: 列名はSeriesの名前がそのまま使われます。dict[Series]: 列名は辞書のキーが使われます。
sx = pl.Series('x', [1, 2, 3])
sy = pl.Series('y', [4, 5, 6])
df1 = pl.DataFrame([sx, sy])
df2 = pl.DataFrame({'A':sx, 'B':sy})
row(df1, df2)
shape: (3, 2)
|
shape: (3, 2)
|
pl.from_*()関数#
from_ で始まる関数は、さまざまなデータをデータフレームに変換します。これらを使うと、意図しないデータ変換が起こりにくくなり、コードの堅牢性を高められます。
pl.from_dict()—dict[list]から変換pl.from_dicts()—list[dict]から変換pl.from_numpy()— NumPy の配列から変換pl.from_records()—list[list]から変換pl.from_pandas()— Pandas のDataFrameから変換pl.from_arrow()— pyarrow のArrayまたはTableから変換
データフレームの属性#
df = pl.DataFrame(
{
"a": [3, 3, 3, 4],
"b": [4.0, 12, 6, 7],
"g": ['A', 'B', 'A', 'B']
}
)
shape 属性でデータフレームの形状(高さ、幅)を取得できます。height と width 属性で高さと幅をそれぞれ取得でき、len() 関数でも高さを取得できます。
print(f"{df.shape = }")
print(f"{df.height = }")
print(f"{df.width = }")
print(f"{len(df) = }")
df.shape = (4, 3)
df.height = 4
df.width = 3
len(df) = 4
columns 属性で列名のリストを取得できます。
df.columns
['a', 'b', 'g']
schema 属性で、列名とデータ型の対応を表す辞書を取得できます。
df.schema
Schema([('a', Int64), ('b', Float64), ('g', String)])
df.schema['g']
String
dtypes 属性で、各列のデータ型のリストを取得できます。
df.dtypes
[Int64, Float64, String]
flags 属性で各列のソート状態を取得できます。つまり、Polars がその列を「すでに並んでいる」と認識しているかどうかが分かります。
このフラグは最適化に効きます。ソート済みと分かっていれば、範囲検索やマージのときに並べ直す手間を省けるからです。
df.flags
{'a': {'SORTED_ASC': False, 'SORTED_DESC': False},
'b': {'SORTED_ASC': False, 'SORTED_DESC': False},
'g': {'SORTED_ASC': False, 'SORTED_DESC': False}}
データフレームからデータ取得#
ここでは、データフレームから列・行・単一の値を取り出す方法を説明します。
列を取得#
Polars で DataFrame から列を Series として取り出す方法はいくつかあります。
DataFrame.to_series()— インデックスで列を取得します。DataFrame.get_column()— 列名で列を取得します。DataFrame.get_columns()— すべての列を取得します。DataFrame.iter_columns()— 列のイテレーターを取得します。
DataFrame.to_series() は、指定したインデックスの列を Series として返します。DataFrame.get_column() は列名を指定して Series を取得します。DataFrame["column_name"] のように辞書形式で列名を指定することもできます。
s1 = df.to_series(0)
s2 = df.get_column('b')
s3 = df['g']
row(s1, s2, s3)
shape: (4,)
|
shape: (4,)
|
shape: (4,)
|
get_columns() は、DataFrame のすべての列を Series のリストとして返します。
sa, sb, sg = df.get_columns()
row(sa, sb, sg)
shape: (4,)
|
shape: (4,)
|
shape: (4,)
|
iter_columns() は、DataFrame の列を1つずつ返します。
for col in df.iter_columns():
print(col.name, col.to_list())
a [3, 3, 3, 4]
b [4.0, 12.0, 6.0, 7.0]
g ['A', 'B', 'A', 'B']
Series オブジェクト#
print(f"{s1.name = }")
print(f"{s1.dtype = }")
print(f"{s1.flags = }")
print(f"{s1.shape = }")
print(f"{len(s1) = }")
s1.name = 'a'
s1.dtype = Int64
s1.flags = {'SORTED_ASC': False, 'SORTED_DESC': False}
s1.shape = (4,)
len(s1) = 4
to_numpy()メソッド#
to_numpy() または to_list() を使うと、Series を NumPy の配列やリストに変換できます。
to_numpy() は通常データをコピーしません(ゼロコピー)。一方 to_list() は必ず Python オブジェクトを作るので、Python 側のライブラリに渡す必要があるときだけ使います。
print(f'{sa.to_numpy() = }')
print(f'{sa.to_list() = }')
sa.to_numpy() = array([3, 3, 3, 4])
sa.to_list() = [3, 3, 3, 4]
DataFrame.to_numpy() で NumPy の配列に変換できます。既定では、すべての値がもっとも上位のデータ型に変換されます。数値と文字列が混在するデータでは、dtype=object の配列になります。
df.to_numpy()
array([[3, 4.0, 'A'],
[3, 12.0, 'B'],
[3, 6.0, 'A'],
[4, 7.0, 'B']], dtype=object)
structured=True を渡すと、構造化配列に変換します。
df.to_numpy(structured=True)
array([(3, 4., 'A'), (3, 12., 'B'), (3, 6., 'A'), (4, 7., 'B')],
dtype=[('a', '<i8'), ('b', '<f8'), ('g', '<U1')])
Series の要素がリストの場合、to_numpy() を呼ぶと dtype=object の配列が得られます。配列の各要素は、さらに配列になっています。このような構造は高速な処理には向きません。
s_list = pl.Series('s_list', [[1, 2, 3], [4, 5, 6], [7, 8, 9]])
s_list.to_numpy()
array([array([1, 2, 3]), array([4, 5, 6]), array([7, 8, 9])], dtype=object)
Series の要素が Array の場合、to_numpy() は多次元配列を返します。
s_arr = pl.Series('s_arr', [[1, 2, 3], [4, 5, 6], [7, 8, 9]], dtype=pl.Array(pl.Int8, 3))
s_arr.to_numpy()
array([[1, 2, 3],
[4, 5, 6],
[7, 8, 9]], dtype=int8)
Series の要素が Struct の場合、to_numpy() は2次元配列を返し、各要素のデータ型はもっとも上位の型にそろえられます。次の例では、Int64 と Float64 が Float64 にそろっています。
s_struct = pl.Series('s_struct', [{"x": 1, "y": 2.0}, {"x": 3, "y": 4.0}, {"x": 5, "y": 6.0}])
s_struct.to_numpy()
array([[1., 2.],
[3., 4.],
[5., 6.]])
NumPy の構造化配列に変換するには、まず struct.unnest() で DataFrame に変換し、そのあと to_numpy(structured=True) を呼びます。
s_struct.struct.unnest().to_numpy(structured=True)
array([(1, 2.), (3, 4.), (5, 6.)], dtype=[('x', '<i8'), ('y', '<f8')])
to_dict()メソッド#
to_dict() で dict[Series] 型の辞書に変換します。
df.to_dict()
{'a': shape: (4,)
Series: 'a' [i64]
[
3
3
3
4
],
'b': shape: (4,)
Series: 'b' [f64]
[
4.0
12.0
6.0
7.0
],
'g': shape: (4,)
Series: 'g' [str]
[
"A"
"B"
"A"
"B"
]}
to_dicts()メソッド#
to_dicts() で list[dict] 型のリストに変換します。1行につき1つの辞書です。
もっとも Python らしい形で、JSON へのシリアライズや外部ライブラリに渡すのに向いています。ただし行ごとにオブジェクトを作るので、大きな表では避けたほうが無難です。
df.to_dicts()
[{'a': 3, 'b': 4.0, 'g': 'A'},
{'a': 3, 'b': 12.0, 'g': 'B'},
{'a': 3, 'b': 6.0, 'g': 'A'},
{'a': 4, 'b': 7.0, 'g': 'B'}]
to_arrow()メソッド#
to_arrow() で pyarrow の Table に変換します。Table は DataFrame と同じメモリを共有するため、変換は高速です。
df.to_arrow()
pyarrow.Table
a: int64
b: double
g: large_string
----
a: [[3,3,3,4]]
b: [[4,12,6,7]]
g: [["A","B","A","B"]]
行を取得#
DataFrame.row(index)— 特定のインデックスにある行をタプルとして取得します。DataFrame.rows()— すべての行をタプルのリストとして取得します。DataFrame.iter_rows()— 各行を順にたどり、タプルとして返します。DataFrame.rows_by_key()— 指定したキーで行をグループ化し、グループごとに行のリストを返します。
DataFrame.row(index) は、指定したインデックス(行番号)の行をタプルで返します。
df.row(2)
(3, 6.0, 'A')
named=True を渡すと、列名を含む辞書として返します。
df.row(2, named=True)
{'a': 3, 'b': 6.0, 'g': 'A'}
by_predicate に条件式を渡すと、条件が True になる行を取得できます。条件に合う行が複数あるとエラーになります。
df.row(by_predicate=pl.col.a == pl.col.a.max())
(4, 7.0, 'B')
DataFrame.rows() は、すべての行をタプルのリストとして返します。データ全体を行単位で扱いたいときに便利です。DataFrame.iter_rows() は、各行を順に取り出すイテレーターを返します。
df.rows()
[(3, 4.0, 'A'), (3, 12.0, 'B'), (3, 6.0, 'A'), (4, 7.0, 'B')]
df.rows(named=True)
[{'a': 3, 'b': 4.0, 'g': 'A'},
{'a': 3, 'b': 12.0, 'g': 'B'},
{'a': 3, 'b': 6.0, 'g': 'A'},
{'a': 4, 'b': 7.0, 'g': 'B'}]
for row_ in df.iter_rows():
print(row_)
(3, 4.0, 'A')
(3, 12.0, 'B')
(3, 6.0, 'A')
(4, 7.0, 'B')
DataFrame.rows_by_key() は、指定したキー(列)で行をグループ化し、キーごとに行のリストを返します。
df.rows_by_key('g')
defaultdict(list, {'A': [(3, 4.0), (3, 6.0)], 'B': [(3, 12.0), (4, 7.0)]})
df.rows_by_key('g', named=True)
defaultdict(list,
{'A': [{'a': 3, 'b': 4.0}, {'a': 3, 'b': 6.0}],
'B': [{'a': 3, 'b': 12.0}, {'a': 4, 'b': 7.0}]})
単一の値#
DataFrame.item() は、データフレームから単一の値を取り出すメソッドです。
df.item(2, 'a')
3
データフレームに値が1つしかない場合は、引数を省略できます。列の統計値を取り出して別の計算に使うときによく用います。
df.select(pl.col('a').mean()).item() / 100
0.0325
[] によるインデックス操作#
Polars のデータフレームは、NumPy や Pandas と同じように [] によるインデックス操作に対応しています。
警告
[] によるインデックス操作は可能ですが、推奨される方法ではありません。filter() や select() などのメソッドを式と組み合わせて使うほうが望ましいです。
次の例では、サンプルデータを使ってインデックス操作を説明します。
df = pl.DataFrame({
"a": [1, 2, 3, 4],
"b": [5, 6, 7, 8],
"c": ["x", "y", "z", "w"],
"d": ["a", "b", "c", "d"]
})
要素の取得#
インデックスが1つの場合
インデックスが1つだけ指定される場合、その型によって挙動が異なります。
整数、整数のリスト、整数のスライスの場合 — 行を選択します。スライスの場合、終了値は含まれません。
row(df[0], df[[0, 2]], df[1:3])
shape: (1, 4)
|
shape: (2, 4)
|
shape: (2, 4)
|
文字列、文字列のリスト、文字列のスライスの場合 — 列を選択します。スライスの場合、終了値が含まれます。
row(df["a"], df[["a", "d"]], df["a":"c"])
shape: (4,)
|
shape: (4, 2)
|
shape: (4, 3)
|
インデックスが2つの場合
インデックスが2つ指定される場合、1つ目は行の選択、2つ目は列の選択に使われます。
行のインデックスには整数、整数のリスト、またはスライスを使用します。
列のインデックスには整数、文字列、整数のリスト、文字列のリスト、またはスライスを使用できます。
両方が単一の値の場合 — 特定の要素を抽出します。結果は Python の基本データ型になります。
print(f"{df[0, 'b'] = }") # 行0、列"b"の値を抽出
print(f"{df[0, 1] = }") # 行0、列インデックス1の値を抽出
df[0, 'b'] = 5
df[0, 1] = 5
列のインデックスがリストやスライスの場合 — 結果は
DataFrameになります。
row(df[0, ["a", "c"]], df[1, "a":"c"], df[2, [0, 1, 3]], df[3, ::2])
shape: (1, 2)
|
shape: (1, 3)
|
shape: (1, 3)
|
shape: (1, 2)
|
row(df[[1, 2], ["a", "c"]], df[[1, 2], "a":"c"], df[2:, [0, 1, 3]], df[2:, ::2])
shape: (2, 2)
|
shape: (2, 3)
|
shape: (2, 3)
|
shape: (2, 2)
|
行のインデックスがリストやスライスで、列のインデックスが単独の要素の場合 —
Seriesが返されます。Seriesは、選択された列の行データを保持します。
row(df[[1, 2], "a"], df[1:, 2])
shape: (2,)
|
shape: (3,)
|
[] でもデータを書き換えられます。方法は2つあります。
列をまとめて置き換える — 列名のリストを指定し、同じ形の NumPy 配列を代入します。
# 列"a"のデータを設定
df[["a"]] = np.array([[10], [20], [30], [40]])
df
| a | b | c | d |
|---|---|---|---|
| i64 | i64 | str | str |
| 10 | 5 | "x" | "a" |
| 20 | 6 | "y" | "b" |
| 30 | 7 | "z" | "c" |
| 40 | 8 | "w" | "d" |
# 列"a"と列"b"のデータを同時に設定
df[["a", "b"]] = np.array([[100, 200, 300, 400], [50, 60, 70, 80]]).T
df
| a | b | c | d |
|---|---|---|---|
| i64 | i64 | str | str |
| 100 | 50 | "x" | "a" |
| 200 | 60 | "y" | "b" |
| 300 | 70 | "z" | "c" |
| 400 | 80 | "w" | "d" |
行・列を指定して特定の要素を変更する場合
行のインデックス: 整数または整数のリストで指定します。
列のインデックス: 整数または文字列で指定します。
この書き方は、わずかな値を直すときのものです。代入のたびに列全体がコピーされることがあり、ループで数千個を書き換えると極端に遅くなります。まとめて変更するなら with_columns() と when().then() を使ってください。
# 単一の行と列のデータを変更
df[1, "a"] = -1
df
| a | b | c | d |
|---|---|---|---|
| i64 | i64 | str | str |
| 100 | 50 | "x" | "a" |
| -1 | 60 | "y" | "b" |
| 300 | 70 | "z" | "c" |
| 400 | 80 | "w" | "d" |
# 複数の行のデータを変更
df[[1, 3], "b"] = -1, -2
df
| a | b | c | d |
|---|---|---|---|
| i64 | i64 | str | str |
| 100 | 50 | "x" | "a" |
| -1 | -1 | "y" | "b" |
| 300 | 70 | "z" | "c" |
| 400 | -2 | "w" | "d" |